| Biologie et Pathologie du Neurone |  |
Journal articles
Cell-Type-Specific Gene Expression Profiling in Adult Mouse Brain Reveals Normal and Disease-State Signatures
Nicolas Merienne
1
Cécile Meunier
2
Anne Schneider
3
Jonathan Seguin
4
Satish Nair
5
Anne Rocher
6
Stéphanie Le Gras
7
Celine Keime
8
Richard Faull
9
Luc Pellerin
10
Jean-Yves Chatton
10
Christian Neri
11
Karine Mérienne
3
Nicole Déglon
12
11
Brain-C - Biologie et Pathologie du Neurone
B2A - Adaptation Biologique et Vieillissement = Biological Adaptation and Ageing
12
LMN - Laboratoire des Maladies Neurodégénératives - UMR 9199
MIRCEN - Service MIRCEN : DRF/JACOB, CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 9199
Richard Faull 9
Author
Luc Pellerin 10
Author
Jean-Yves Chatton 10
Author
Christian Neri 11
Author IdHAL : christian-neri ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3790-2978
Karine Mérienne 3
Author
Nicole Déglon 12
Author
1
CHUV - Centre Hospitalier Universitaire Vaudois [Lausanne] (Rue du Bugnon 21
CH-1011 Lausanne, Vaud - Switzerland)
2
UNIROUEN UFR Santé - UNIROUEN - UFR Santé (22 boulevard Gambetta - CS 76183 - 76183 Rouen cedex 1 - France)
- UNIROUEN - Université de Rouen Normandie (1, rue Thomas Becket 76821 Mont-Saint-Aignan Cedex - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
3
LNCA - Laboratoire de neurosciences cognitives et adaptatives (Faculté de psychologie
12 rue Goethe
67000 Strasbourg - France)
- UNISTRA - Université de Strasbourg (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7364 (France)
4
DIRO - Département d'Informatique et de Recherche Opérationnelle [Montreal] (Département d'Informatique et de recherche opérationnelle Université de Montréal Pavillon André-Aisenstadt CP 6128 succ Centre-Ville Montréal QC H3C 3J7 Canada - Canada)
- UdeM - Université de Montréal (2900 Boulevard Edouard-Montpetit, Montréal, QC H3T 1J4 - Canada)
5
SU - Sorbonne Université (21 rue de l’École de médecine - 75006 Paris - France)
6
RDP - Reproduction et développement des plantes (bat. LR5 46 Allée d'Italie 69364 LYON CEDEX 07 - France)
- ENS Lyon - École normale supérieure - Lyon (15 parvis René Descartes - BP 7000 - 69342 Lyon Cedex 07 - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UR0879 (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5667 (France)
7
IGBMC - Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (Parc D'Innovation 1 Rue Laurent Fries - BP 10142 67404 Illkirch Cedex - France)
- UNISTRA - Université de Strasbourg : UMR7104 (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1258 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7104 (France)
8
CGPhiMC - Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire (bat. 741 43 Bvd du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5534 (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
9
University of Auckland [Auckland] (Private Bag 92019 Auckland 1142 - New Zealand)
10
UNIL - Université de Lausanne (CH-1015 Lausanne - Switzerland)
11
Brain-C - Biologie et Pathologie du Neurone
- B2A - Adaptation Biologique et Vieillissement = Biological Adaptation and Ageing (Campus de Jussieu - 4 place Jussieu 75005 Paris - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- IBPS - Institut de Biologie Paris Seine (Quai Saint-Bernard
75252 PARIS CEDEX 05 - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : FR 3631 (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1164 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8256 (France)
12
LMN - Laboratoire des Maladies Neurodégénératives - UMR 9199 (18 Route du panorama CEA Fontenay-aux-Roses Bâtiment 61 92 265 Fontenay-aux-Roses CEDEX Tel : 00 33 (0)1 46 54 84 11 - France)
- MIRCEN - Service MIRCEN : DRF/JACOB (Molecular Imaging Research Center (Fontenay-aux-Roses) - France)
- JACOB - Institut de Biologie François JACOB : DRF/JACOB/MIRCEN (DRF
CEA
Fontenay-aux-Roses - France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/JACOB (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/JACOB (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
- JACOB - Institut de Biologie François JACOB : DRF/JACOB/MIRCEN (DRF
CEA
Fontenay-aux-Roses - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 9199 (France)
Abstract : The role of brain cell-type-specific functions and profiles in pathological and non-pathological contexts is still poorly defined. Such cell-type-specific gene expression profiles in solid, adult tissues would benefit from approaches that avoid cellular stress during isolation. Here, we developed such an approach and identified highly selective transcriptomic signatures in adult mouse striatal direct and indirect spiny projection neurons, astrocytes, and microglia. Integrating transcriptomic and epigenetic data, we obtained a comprehensive model for cell-type-specific regulation of gene expression in the mouse striatum. A cross-analysis with transcriptomic and epigenomic data generated from mouse and human Huntington’s disease (HD) brains shows that opposite epigenetic mechanisms govern the transcriptional regulation of striatal neurons and glial cells and may contribute to pathogenic and compensatory mechanisms. Overall, these data validate this less stressful method for the investigation of cellular specificity in the adult mouse brain and demonstrate the potential of integrative studies using multiple databases.
Document type :
Journal articles
Domain :
Complete list of metadatas
https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-02472468
Contributor : Karine Viaud <>
Submitted on : Monday, February 10, 2020 - 11:37:18 AM
Last modification on : Thursday, December 10, 2020 - 11:07:29 AM
Long-term archiving on: : Monday, May 11, 2020 - 1:38:27 PM
Contributor : Karine Viaud <>
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File
mmc8.pdf
Publisher files allowed on an open archive
Identifiers
- HAL Id : hal-02472468, version 1
- DOI : 10.1016/j.celrep.2019.02.003
Collections
CNRS | IGBMC | INRA | RDP | CGPHIMC | ENS-LYON | CEA | CEA-UPSAY | UNIV-LYON1 | B2A-BRAIN-C | COMUE-NORMANDIE | JACOB | CEA-DRF | SITE-ALSACE | UNIROUEN | SORBONNE-UNIVERSITE | MIRCEN | B2A | IBPS | UDL | CRMSB | SU-SCIENCES | INRAE | SU-TI
Citation
Nicolas Merienne, Cécile Meunier, Anne Schneider, Jonathan Seguin, Satish Nair, et al.. Cell-Type-Specific Gene Expression Profiling in Adult Mouse Brain Reveals Normal and Disease-State Signatures. Cell Reports, Elsevier Inc, 2019, 26 (9), pp.2477-2493.e9. ⟨10.1016/j.celrep.2019.02.003⟩. ⟨hal-02472468⟩
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